病気の種類と個別の対策
腐蛆病（アメリカ腐蛆病）
国際獣疫事務局(OIE)疾病リスト登載
蜂児が死亡すると蜂児蓋が張りを失って凹み，働き蜂がその後小孔をあけます．このような状態の蜂児はマッチの軸などを差し込むと，粘りの強い糸を引きます（左図，ヨーロッパ腐蛆病では糸は引かない）．最終的には蓋は取り除かれ，硬化した死体が巣房の下面に残ります（右図：中央二つの巣房）．これをスケールといいますが，巣板を上方からのぞき込むようにしてみると，見つけやすいので，空巣板になったときに時々点検するとよいでしょう．また，感染して蜂児が死に始めると異臭が漂うので，巣箱を空けたときに強い刺激臭を感じた場合には，発症を疑うことになります．
腐蛆病（ヨーロッパ腐蛆病）
国際獣疫事務局(OIE)疾病リスト登載
蜂児は溶けた状態に見えますが，糸は引きません．蓋をしていない幼虫の死亡が目立つのが特徴です．ただ，一般的な生理死（換気不足や餓死）などでも同じような見かけになるので，診断には注意が必要です（生理的な死の場合はより小さな幼虫も蛹も死んでいることが多いです）．チョーク病
ハチノスカビ Ascospharera apis
日本ではよく発生が知られています．幼虫期に体内に入ったカビの胞子が蛹の時期に全体に菌糸を伸ばして，白いチョーク状の塊となるのでこの名称があります．発症には低温への暴露が必要で，30度以下の温度に長時間蜂児をさらすと，発症率が高まることが知られています．
一般的に一過性で自然治癒しやすい病気ですが，蜂場の環境や，巣箱状態が悪いなど，飼育上の問題が原因で，発症を抑えられず，長期化させてしまうこともあります．
巣門付近にこの白いチョーク（時間がたつと黒くなる）が散乱し始めたら，感染が広がっていると考えます．落ちている数と発症の程度は比例しています．感染が長引いて，巣箱の底や巣板上に除去されていないものが増えたら，自然治癒は難しくなります．
一般的に自然治癒しますが，感染がひどい場合は，蜂児を一時的にない状態にして（女王を隔離して産卵を停止させる），巣内での感染を絶ちます．
ノゼマ病
届出家畜伝染病指定(1999)
主な症状は成虫による下痢で，巣箱の表面が糞で汚れることが診断のサインとなります．このような蜂群からとりだした働き蜂は，腸管の弾力や透明感がなくなり，もろくなっています．腸管の顕微観察で原虫が見られれば，ノゼマ病と診断します．バロア病
ミツバチヘギイタダニVarroa destructor
届出家畜伝染病指定(1999)
外部寄生性の吸血ダニによる感染症です．防除が必要な病気の一つで，原因となるミツバチヘギイタダニは，吸血による羽化不全（写真右のような翅伸不良を代表的な症状＝縮れ翅），吸血孔からの細菌の感染による敗血症，ウイルスの媒介などを通じて，蜂群に大きな影響を与えます．このダニは，春期には雄蜂の蜂児で繁殖するため，ダニが発生していても蜂群への影響は限定的で気づきにくいことが多いです．ところが，夏になると，雄の生産が停止するため，大量のダニが一気に働き蜂の蜂児に寄生するようになり，多くの場合，重寄生となって寄生された働き蜂が羽化できないため，蜂群の壊滅など重大な被害につながります（夏の大発生）．
体表に成ダニを付着させた働き蜂が目につくようになるのが第一段階です．この時期には雄の蜂児を取り出すと多くの場合ダニが寄生しています．羽化不全の働き蜂が時折巣板上に見られるのが第2段階で，この段階で薬剤による防除が必要です．巣門前に蛹や翅の伸展不良の成蜂がが捨てられるようになるのが第3段階で，この段階ではかなりの働き蜂の蛹が寄生を受けていて，蜂群の壊滅も間近です．
巣箱の底にも捨てきれなかった羽化直前の蛹とダニの死体が大量に見られるようになっては，すでに投薬しても蜂群を救うことはできません．
巣の素材であるろうには蓄積していくので，アピスタンを使用した蜂群から得られた蜂ろうを，食用や化粧品素材として用いることはお勧めできません．
アカリンダニ症
届出家畜伝染病指定(1999)
ダニそのもの影響は小さく，成虫寿命にある程度短縮の影響が出るといわれている程度です．しかし，ダニが吸血する際にウイルスを媒介する可能性があると考えられ，何らかの病気が蔓延してきた場合に，迷い込みや盗蜂などで病群と健常群の働き蜂の接触が起こると，病気の媒介者となる可能性が指摘されています．また，ウイルスの影響が強くでるような相互作用も報告されています．
ミツバチトゲダニ症
ケーニガーミツバチトゲダニT. koenigerum
外部寄生性の吸血ダニによる感染症です．原産地の東南アジアでは，バロアよりも大きな被害をもたらすといわれているこのダニは，すでに韓国には侵入していますので，日本でも侵入に対しては要警戒です．低温に弱く，蜂児がいなければ生存できないので，越冬条件が厳しい地域（女王蜂の産卵が1月程度停止する）では，発生することはないと考えられています．
ハチノスムクゲケシキスイ
（スモール・ハイブ・ビートル）症
麻痺病
写真中央の個体のように，胸部背面および腹部の体毛が脱落し，黒く見えるようになります．また，こうした個体が増えてくると，巣門付近で，正常に動けず，体を痙攣させながら歩いているものを見かけるようになることもあります．巣門に出た蜂はやがて巣門付近で死んでいき，症状が重い場合には，巣門前に数百等の死体が見られることがあります．その場合の死体も，上記のような見かけとなっていて，農薬などの中毒死とははっきりした区別がつきます．
サックブルード病
ウイルスに感染した蜂児が，前蛹期に袋状になり，東部側に水がたまった状態（右図）になるので，この名前があります．
東南アジアから南アジアにかけては，1980年代を中心に多数のトウヨウミツバチがこのウイルスが原因で死亡（蜂群が壊滅）したとされています（タイサックブルードと呼ばれています）．現在でもトウヨウミツバチでは主要な病気ですが，セイヨウミツバチでは重症例は知られていません．
トウヨウミツバチの場合特に重症でなくても，蜂群あたり数百の感染巣房を見ることができます．巣房蓋は働き蜂によって破られ，死蜂児は取り除かれます．しかし，完全な除去には時間がかかり，蜂児の体の一部が巣房に残っているのが見られます（右図，下段中央の巣房など）．スムシ（ハチノスツヅリガ）
ニホンミツバチではスムシによる食害のために逃去するといわれていますが，実際には，別の原因で先行して弱小化していて，スムシの食害を自力で防ぐことができない状態に陥っているというケースがほとんどです．つまりスムシは第一の原因ではないので，本来の原因を追及する必要があります．
セイヨウミツバチでも弱小群が夏にまだミツバチがいるにもかかわらず食害を受けることがあります（右図）．
実際には保存中の巣板への食害が問題となります．
病気の対策
病気に対して，ミツバチ自身も基本的には抵抗性をもっています．蜂児の病気に関しては，異常のある蜂児を捨てることで蔓延を制限しています．しかし，蜂児と成蜂のバランスが崩れると，異常個体の除去は難しくなり，また巣内の環境維持も困難になるため，蜂児の成長が乱れ，弱った蜂児が感染して死亡するようになります．特に低温期や餌の欠乏期に弱小群を作らないこと，ダニの診断を行い，夏の大発生（上記注）を防ぐことが重要です．また，弱小化した蜂群に関しては，原因がある程度はっきりするまでは合同などをしない方が安全です．巣板の共有にも充分気を遣い，健常群への感染経路を絶つ工夫が必要です．
健常群として維持できる強群とは30000匹以上で，巣板10〜12枚以上のものを指します．原則として，巣板1枚に2000匹以上となるような密度が最適です．この密度が低くなること＝巣の面積と働き蜂のバランスの悪化となります．ミツバチを「混んだ」状態で飼育することが重要です．巣板が多すぎる場合には調整して下さい．
また飼育環境に関しては，木立に囲まれた湿気の多い場所に蜂場を構えている場合は，空気がよどみやすく，また降雨のあと，蜂場内に水がたまりやすいです．できるだけ乾いた空間に巣箱を設置することを心がけて下さい．趣味養蜂で，天候にかかわらず内検作業が必要になる場合には，雨が吹き込まないように屋根を設け，地面からできるだけ離して巣箱を設置するとよいでしょう．
特に越冬中に，結露などによって巣箱内の環境は悪化しています．春早い時期に巣箱を交換するのがよいでしょう．それに先だって，使用していない巣箱をよく水洗いをして，内部に付着しているろうやプロポリスなどをハイブツールを用いて完全に取り除きます．
水洗後は，よく乾燥させ，バーナー等（現在は園芸用や工作用のガスバーナーが各種販売されています）を用いて内部をまんべんなく火炎消毒します．表面が軽く焦げる程度で，基本的な効果が得られます．巣箱を交換後は，越冬に使用した巣箱についても同様の措置をしておきます．給餌枠や分割板，隔王板なども，同様に水洗と火炎消毒で充分な病気の感染防止となります．
なお，
水洗時に消毒剤などを用いるオプションもありますが，現在は登録されている消毒剤がないので，使用は自己責任となることを理解して下さい．
最大の感染源は巣板です．定期的な更新を行って，感染のリスクを下げる工夫が必要です．春の腐蛆病予防措置のあとに巣礎枠を入れ，建勢を促し，それまで蜂児巣板だったものを上段に上げて，貯蜜用とします．毎年，春には，巣礎を加えるごとに古いものから貯蜜用に回します（新しい巣板は採蜜時に分離器の遠心力に耐えられないため，巣礎からできたばかりの巣板は採蜜用には使えません）．蜂児枠は21日後には完全に蜂児の出房が完了するので，採蜜に向けて計画的に貯蜜部（例えば隔王板で仕切った上段部分）へ移動します．．
3年間で50％以上を更新させ，また育児に用いる巣板を2年目の巣板までとすることで，感染リスクは大幅に減少します．